La única hermana de Eugenio, Eugénie, y su marido Armand tuvieron cinco hijos: Nathalie, Caroline, Louis, Césarie y Eugenio. Los tres primeros murieron en la adolescencia y Césarie se había casado en Italia en julio de 1847. Eugenio fue el único sobrino sobreviviente del Fundador. El biógrafo Rey menciona su matrimonio el 25 de noviembre de 1847:
«El día 25, Mons. de Mazenod tuvo el consuelo de bendecir el matrimonio de su sobrino, el marqués Eugenio de Boisgelin, en su capilla, en presencia de una selecta congregación.
Su discurso, lleno de recuerdos familiares y acompañado de una emoción tenue pero muy fuerte, causó una profunda impresión.»
(Rey p. 261)
“De 1841 a 1847, Armando y Mons. de Mazenod le buscan una esposa. Varios proyectos fracasan porque no se encuentran muchachas suficientemente ricas, o porque Eugenio es difícil; él sólo quiere a una joven que ya conoce, que sea música, etc. Finalmente, Mons. de Mazenod bendice el matrimonio de Eugenio con Angélica Sallony, en su capilla, el 25 de noviembre de 1848. Como regalo de bodas, le da el hotel de Boisgelin, que había comprado algunos años antes. Eugenio y Angélica tuvieron siete hijos.” (https://www.omiworld.org/es/lemma/boisgelin-armand-natal-de-y-familia-es/)
Hoy sus descendientes siguen venerando al santo de su familia, al que aún se refieren cariñosamente como su «Tío Eugenio». Más de 200 descendientes de Boisgelin estuvieron presentes en Roma para su canonización en 1995.